存货核算系统使用流程如下
第一步，基础设置
在存货核算系统使用前，需要先设置组织机构（核算组织）、会计政策、会计核算体系、核算范围、物料计价方法、系统参数及费用项目（有预设值，可以不设置也可根据需求自定义）。
首先，用系统管理员（administrator）进入数据中心设置组织机构；
进入基础管理－>系统管理－>组织机构－>组织机构列表，新增组织机构。
其次，用用户账号进入数据中心依次设置会计政策、会计核算体系、核算范围、物料计价方法、参数设置及费用项目，路径如下：
进入基础管理－>基础资料－>公共资料－>会计政策
进入财务会计－>总账－>基础资料－>会计核算体系
进入成本管理－>存货核算－>基础资料－>核算范围
进入成本管理－>存货核算－>基础资料－>物料计价方法
进入成本管理－>存货核算－>基础资料－>物料计价方法变更
进入成本管理－>存货核算－>基础资料－>退料残值率维护
进入成本管理－>存货核算－>参数设置－>存货核算系统参数
进入基础管理－>基础资料－>公共资料－>费用项目
第二步，初始化
首先，启用存货核算系统
进入成本管理－>存货核算－>初始化－>启用存货核算系统
其次，初始核算数据录入（存在期初库存时才需维护）
进入成本管理－>存货核算－>初始化－>初始核算数据录入
再次，存货核算初始化
进入成本管理－>存货核算－>初始化－>存货核算初始化
初始化后，初始核算数据是不能再维护的，若需修改初始核算数据，进入“存货核算初始化”中进行反初始化处理。
第三步，存货核算
首先，采购入库核算
审核应付单：进入财务会计－>应付管理－>应付确认－>应付单
采购费用分配：进入成本管理－>存货核算－>存货核算－>采购费用分配
钩稽日志查询：进入成本管理－>存货核算－>存货核算－>钩稽日志查询
采购入库核算：进入成本管理－>存货核算－>存货核算－>入库成本核算
其次，成本暂估及成本调整
入库成本维护：进入成本管理－>存货核算－>存货核算－>入库成本维护
委外入库核算：进入成本管理－>存货核算－>存货核算－>委外入库核算
成本调整：进入成本管理－>存货核算－>成本调整－>成本调整单
再次，出库成本核算
出库成本核算：进入成本管理－>存货核算－>存货核算－>出库成本核算
其他存货成本核算：进入成本管理－>存货核算－>存货核算－>其他存货核算
第四步，报表分析
核算单据查询：进入成本管理－>存货核算－>报表分析－>核算单据查询
存货核算汇总报告：进入成本管理－>存货核算－>报表分析－>存货核算汇总报告
存货核算明细报告：进入成本管理－>存货核算－>报表分析－>存货核算明细报告
存货收发存汇总报告：进入成本管理－>存货核算－>报表分析－>存货收发存汇总报告
存货收发存明细报告：进入成本管理－>存货核算－>报表分析－>存货收发存明细报告
异常余额汇总表：进入成本管理－>存货核算－>报表分析－>异常余额汇总表
第五步，账务处理
业务凭证生成：进入成本管理－>存货核算－>财务处理－>业务凭证生成
业务凭证查询：进入成本管理－>存货核算－>财务处理－>业务凭证查询
总账凭证生成：进入成本管理－>存货核算－>财务处理－>总账凭证生成
总账凭证查询：进入成本管理－>存货核算－>财务处理－>总账凭证查询
第六步，期末处理
期末关账：进入成本管理－>存货核算－>期末处理－>期末关账
期末结账：进入成本管理－>存货核算－>期末处理－>期末结账